Aqaba liegt ganz im Süden Jordaniens, direkt am Golf von Aqaba, einem Seitenarm des Roten Meeres, und ist die einzige Hafenstadt des Landes mit Zugang zum Meer. Sie befindet sich an der Südspitze Jordaniens nahe der Grenzen zu Israel (gegenüber liegt Eilat), Ägypten und Saudi-Arabien.